Đặc Vụ Tại Gia kể về Kang Moo (Hwang Jung Min) một cựu sĩ quan đặc nhiệm hiện đang sống cuộc sống của một người chồng nội trợ tận tụy. Anh cố gắng che giấu quá khứ bí ẩn của mình trước vợ là Mi Sun (Yum Jung Ah) một nữ cảnh sát điều tra tội phạm bạo lực. Tưởng chừng như mọi thứ đang trôi qua một cách êm đềm, cho đến khi một ngày, một người phụ nữ bí ẩn tên Hee Joo (Jeon Hye Jin) xuất hiện và gây xáo trộn cuộc sống của Kang Moo.