Chuyến Tàu Tận Thế kể về Kayashima Naoya (Yuki Yamada) phải vật lộn để tồn tại trong điều kiện khắc nghiệt khi chuyến tàu mà anh ta đang đi đến một thế giới tương lai bị tàn phá, nơi không có thức ăn, nước uống hay thông tin liên lạc.